| 微量小鼠冰冻脑组织ChIP实验——探讨压力对转录因子结合和5hMC的影响 |
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内容介绍：
虽然我们知道，压力是诸多引起神经精神异常的重要因素之一，但是对于压力如何诱发脑化学物质的变化，继而导致精神疾病发生的分子机制却知之甚少。因此，该研究关注异常环境敏感的DNA甲基化标记-5羟甲基胞嘧啶（5hmC），及其在应对压力时对转录因子（TF）的影响。
我们采用Covaris Chip方案，使用微量小鼠脑组织样本，通过ChIP实验表明，压力显著降低转录因子与目标基因的结合能力，目标基因上5hmC水平上调。通过EMSA凝胶迁移实验和WB实验，进一步证实ChIP-qPCR实验中的发现。这些实验结果一起表明，在压力情况下，5hmC改变了转录因子的结合能力。
在该研究工作中：
l观察到压力会引起重要的压力相关的糖皮质激素受体基因(Nr3c1)上５－羟甲基胞嘧啶（5hmC）水平的显著上调；
l5HMC的基因组图谱揭示了全基因组的应激中断反应，以及含差异羟甲基化区域（DHMR）的基因在神经元通路中的显著富集，提示了生物相关性；
l通过后续与来自相同老鼠脑组织样本RNA-Seq实验数据的整合分析，鉴定到5hmC水平和表达水平均有变化的基因；
l发现转录因子结合富集区，揭示5hmC可能通过调节雄性和雌性老鼠中转录因子的结合能力，来调节基因表达。
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| Sisi Li PhD |
| 威斯康星大学麦迪逊分校 |
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| 神经科学领域专业研究人员 |
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简介
讲座题目：
微量小鼠冰冻脑组织ChIP实验——探讨压力对转录因子结合和5hMC的影响
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