一种潜在的早期食管癌抗原：DDX53

“在这项ESCA研究中，讨论了选择缺乏DDX53 CTA的肿瘤细胞的免疫反应的可能性。”

一篇新的研究论文于2023年11月10日发表在《肿瘤科学》(第10卷)上，题为“睾丸癌抗原DDX53作为潜在早期食管癌抗原的免疫信息学评估”。

t淋巴细胞参与促进促炎、促肿瘤微环境，从而恶化食管癌(ESCA)的预后。在他们的新研究中，来自南佛罗里达大学、俄勒冈健康与科学大学医院和H. Lee Moffitt癌症中心和研究所的研究人员Peter Cheng、Konrad J. Cios、Mallika Varkhedi、Vayda R. Barker、Michelle Yeagley、Andrea Chobrutskiy、Boris I. Chobrutskiy和George Blanck，t细胞受体(TCR)互补决定区域3 (CDR3)氨基酸序列，并采用特别适合大数据设置的算法来评估TCR CDR3-癌睾丸抗原(CTA)化学互补。

“为了更好地了解t细胞在ESCA中的潜在积极和消极影响，我们从TCGA-ESCA全外显子组序列(WXS)文件中恢复了TCR重组reads，获得了TCR CDR3 AA序列，并评估了这些序列与cta的化学互补性，因为这些抗原在过去几十年里被许多方法描述为候选癌症抗原。”

ESCA TCR CDR3s和睾丸癌抗原DDX53的化学互补性代表了无病生存(DFS)的区别，其中，50百分位互补性较高的组与较差的DFS相关。高TCR CDR3-DDX53互补组也代表了更大比例的缺乏DDX53表达的肿瘤样本。这些数据和分析提出了一个问题，即TCR CDR3-DDX53化学互补性评估是否检测到选择ddx53阴性细胞的ESCA免疫反应。

“总的来说，这些数据与tcr -抗原相互作用诱导选择性压力导致抗原丢失的可能性是一致的，这一过程被称为免疫编辑[16-18]，最终，肿瘤细胞从抗肿瘤免疫反应中逃脱。这些ESCA的数据也与卵巢癌背景下高CS、低生存率的类似数据一致。”