lncRNA 60967.1-PLCD4-ATRA轴调控结直肠癌进展及免疫应答的多组学整合研究

本研究针对结直肠癌(CRC)免疫治疗耐药性难题，通过整合转录组、蛋白质组和代谢组多组学分析，首次揭示了lncRNA 60967.1通过调控PLCD4/ATRA轴增强IFN-γ信号通路、逆转免疫抵抗的关键机制。研究发现该轴可促进CD8+ T细胞浸润，并与抗PD-1疗法产生协同抑瘤效应，为CRC精准免疫治疗提供了新靶点。

PanDerm：一种多模态皮肤病学基础模型在临床诊疗中的突破性应用

皮肤疾病诊断面临多模态影像整合与复杂临床需求的挑战，研究人员开发了多模态皮肤病学基础模型PanDerm。该模型通过自监督学习在210万张真实世界皮肤图像上预训练，覆盖4种影像模态，在28项临床任务中实现性能突破，尤其在早期黑色素瘤检测（提升10.2%）、皮肤癌诊断准确率（提升11%）和非专科医生鉴别诊断（提升16.5%）方面表现卓越。研究为医学多模态基础模型开发提供了范式，发表于《Nature Medicine》。

CellNEST：基于空间转录组和注意力机制揭示细胞间中继通讯网络的创新方法

细胞间通讯(CCC)异常是癌症等复杂疾病的关键因素，但现有scRNA-seq和空间转录组分析方法存在高假阳性率、无法检测单细胞间信号传递等局限。研究者开发了CellNEST模型，首次实现基于图注意力网络(GAT)和深度图信息最大化(DGI)的单细胞分辨率中继网络(ligand-receptor-ligand-receptor)检测，在淋巴组织、肺腺癌和胰腺癌中发现关键CCC模式，为精准治疗提供新靶点。该成果发表于《Nature Methods》。

空间转录组学质控新方法SpotSweeper：精准识别局部异常与区域伪影的空间感知技术

【编辑推荐】针对空间转录组学(SRT)数据因空间生物学效应导致的质控(QC)难题，研究人员开发了空间感知方法SpotSweeper。该方法通过局部邻域分析校正空间混杂效应，首次实现局部异常点与区域组织伪影的双重检测。在Visium平台数据验证中，系统识别低质量条形码位点及两类区域伪影，为多技术SRT数据可靠性提供通用解决方案。

大脑功能连接图谱构建方法的系统比较与优化：239种配对统计量的全面评估

本研究针对功能连接(FC)研究中默认使用Pearson相关系数的局限性，系统评估了239种配对统计量在构建大脑功能网络中的表现。研究人员通过HCP数据集分析发现，不同统计量在拓扑组织、结构-功能耦合、个体识别和脑行为预测等方面存在显著差异，其中基于精度(precision)的统计量在多个指标上表现优异。该研究为针对不同神经生理机制和研究问题优化FC方法提供了重要指导。