Structure确定了新出现的SARS-CoV-2变体的结构特征

严重急性呼吸综合征冠状病毒2型(SARS-CoV-2)继续适应群体免疫背景并进化成许多亚变体。

中国科学院微生物研究所高富(George Fu Gao)教授实验室揭示了新发现的SARS-CoV-2亚型BA.2.86、j .1、EG.5、EG.5.1和HV.1亚型的刺突(S)蛋白结构，并对这些亚型进行了系统的比较分析。研究结果发表在《结构》杂志上。

从BA.2进化而来的亚变体主要分为两个分支。以BA.2.86和JN.1为代表的分支在S蛋白受体hACE2的诱导下更容易呈现“3-受体结合域(rbd)向上”的状态。而以XBB、EG.5、HV.1为代表的分支在hACE2诱导下更容易出现“2- rbd -up, 1-RBD-down”的状态。

与其他亚变体相比，BA.2.86所代表的分支由于K356T突变，在残基354处携带了一个新的n -糖基化位点，该糖基化位点影响了RBD与抗体(如S309)的结合。与2022年流行的BA.2菌株相比，BA.2.86和JN.1的RBD表面发生了明显的静电变化，增强了它们的免疫逃逸能力。其中BA.2.86比其子代JN.1具有更高的受体结合亲和力，逃脱了更多的抗体。

结构分析表明，BA.2.86 RBD中的R493Q恢复突变促进了受体结合，而JN.1 RBD中的L455S突变降低了受体结合亲和力。

本研究支持了实验室之前的观点，即在SARS-CoV-2亚变体的进化过程中，免疫逃逸逐渐增强，而受体结合能力波动并保持在中等范围内(5-40 nM)。