Nature Microbiology填补知识空白：肠道微生物和抗生素缺失的拼图

肠道是一个由众多微生物组成的复杂生态系统，在人类健康中起着关键作用。饮食变化、药物或胆汁盐等因素都会影响微生物群，影响健康。在人类普遍存在的肠道细菌中有多形拟杆菌（Bacteroides thetaiotaomicron），这些肠道微生物在消化过程中分解多糖，有助于人体健康。然而，当生态系统失衡时，比如抗生素治疗后，它们也会促进感染。然而，使这些肠道微生物适应环境的分子机制在很大程度上仍然未知。

Alexander Westermann总结了今天发表在《自然微生物学》杂志上的这项研究的目标，他说:“我和我的团队想要了解拟杆菌是如何适应肠道中不断变化的环境的。”

为了阐明拟杆菌(Bacteroides thetaiotaomicron)的转录网络，HIRI的科学家与美国加州大学伯克利分校的研究人员合作，绘制了转录单元，并描述了它们在不同实验条件下的表达。将这些基因表达信息与来自基因工程细菌变异的文献适应度数据进行比较，研究小组能够全面了解调控网络和sRNAs在细菌适应中的功能作用。“我们的发现为环境因素、基因表达和细菌适应性之间复杂的相互作用提供了新的见解，”Westermann说。

小RNA调节抗生素敏感性

研究人员通过研究拟杆菌的核酸含量，发现了一种特殊的调控RNA分子——一种小RNA (sRNA)，会影响细菌对四环素类抗生素的敏感性。“随着sRNA MasB的发现及其在调节抗生素敏感性中的作用，我们揭示了一种以前未被描述的调节机制，”第一作者、博士后研究员Daniel Ryan说。结果提供了抗生素治疗对微生物群成员影响的信息。在此基础上，可以开发新的策略来预防抗生素对有益菌的附带损伤，并改进治疗方法。

这些发现为微生物群落提供了宝贵的资源：通过网络浏览器“Theta-Base”可以公开获得的综合转录组图谱，为研究更多的sRNA和探索它们在这种情况下的功能提供了机会。“拟杆菌和其他肠道微生物群成员的RNA生物学仍然知之甚少。这种研究努力为未来的调查奠定了基础，为进一步的探索提供了基础资源，”Westermann说。