这种方法对于研究DNA是如何缠绕在蛋白质上并塞进细胞核的，以及基因在这个泥淖中的位置如何影响它们的活性的研究人员来说可能特别有用。我们可以把DNA想象成“一串线性的信息，它必须在5微米大小的细胞核内被压缩和组织起来”，麻省剑桥市哈佛大学的遗传学家Jason Buenrostro说，他也是这份预印本的作者之一。“关于折叠是如何发生的，有很多信息。”

为了提取这些信息，Buenrostro和他的同事混合了之前报道的两种方法。一种方法是给细胞喂一种用于复制DNA的特殊酶，以及一套荧光标记的DNA成分，这些成分将被一个接一个地整合到正在生长的DNA链中。通过读取添加荧光标记的序列，研究人员可以确定基因组片段的序列。

研究人员早就知道如何用标签标记蛋白质以跟踪它们的位置。但是光学显微镜的分辨率受限于光的波长，这使得它很难区分荧光标记的DNA链或非常接近的蛋白质。这在原子核的狭窄范围内造成了一个特殊的问题。

因此，研究小组增加了另一种叫做膨胀显微镜的方法。这种技术依赖于一种渗透细胞的凝胶，当它吸收水分时就会膨胀——很像一次性尿布的填充物。当凝胶膨胀时，它会使分子进一步分离，从而更容易区分蛋白质分子。

这两种方法的结合使Buenrostro的团队能够研究患有哈钦森-吉尔福德早衰综合征的人细胞中蛋白质和基因之间的相互作用。哈钦森-吉尔福德早衰综合征是一种导致过早衰老的遗传疾病。这种情况是由一种叫做层状蛋白的蛋白质的突变引起的，这种蛋白质通常在细胞核的周围发现。研究人员证实了先前的研究结果，即在早衰症患者中，这些异常的纤层蛋白侵入细胞核内部，在那里它们似乎改变了染色体的典型排列并抑制了基因活性。在一名92岁无早衰症的供体皮肤细胞中也出现了类似的异常。