为了研究SARS-CoV-2病毒的持久性，巴斯德研究所的科学家与CEA的IDMIT(创新治疗传染病模型)中心合作，分析了被该病毒感染的动物模型的生物样本。该研究的初步结果表明，在感染后6至18个月，在一些人的肺部发现了病毒，尽管在上呼吸道或血液中检测不到病毒。另一个发现是，欧米克隆菌株肺部持续病毒的数量低于原始的SARS-CoV-2菌株。

该研究的第一作者、巴斯德研究所艾滋病毒、炎症和持久性部门的研究员Nicolas Huot指出:“我们真的很惊讶地发现，经过这么长时间的常规PCR测试，在某些免疫细胞——肺泡巨噬细胞中发现了病毒。更重要的是，我们培养了这些病毒，并且能够使用我们开发的研究艾滋病毒的工具观察到它们仍然能够复制。”

为了了解先天免疫在控制这些病毒库中的作用，科学家们随后将注意力转向NK(自然杀伤细胞)细胞。“先天免疫的细胞反应是身体的第一道防线，到目前为止，在SARS-CoV-2感染中几乎没有研究过，”Michaela Müller-Trutwin说。“然而，人们早就知道NK细胞在控制病毒感染方面发挥着重要作用。”研究表明，在一些动物中，感染SARS-CoV-2的巨噬细胞对NK细胞的破坏产生抗性，而在另一些动物中，NK细胞能够适应感染(称为适应性NK细胞)并破坏抗性细胞，在这种情况下是巨噬细胞。

因此，该研究揭示了一种可能解释“病毒库”存在的机制:虽然携带少量或没有长期病毒的个体具有适应性NK细胞生产，但携带较高水平病毒的个体不仅缺乏适应性NK细胞，而且NK细胞活性降低。因此，先天免疫似乎在控制持久性SARS-CoV-2病毒方面发挥了作用。