用唾液体检？“糖组学”可以揭示不同类型的癌症

在未来，一点点唾液可能就足以检测出早期的癌症。哥德堡大学的研究人员已经开发出一种有效的方法来解释癌细胞中糖分子的变化。

聚糖是一种糖分子结构，与我们细胞中的蛋白质相连。聚糖的结构决定了蛋白质的功能。一段时间以来，人们已经知道聚糖结构的变化可以表明体内的炎症或疾病。现在，哥德堡大学的研究人员已经开发出一种方法来区分不同类型的结构变化，这可能为特定疾病的变化提供精确的答案。

“我们分析了大约220名患有11种不同诊断癌症的患者的数据，并确定了聚糖亚结构的差异，这取决于癌症的类型。通过让我们新开发的方法，通过人工智能增强，通过大量数据，我们能够找到这些联系，”哥德堡大学生物信息学副高级讲师Daniel Bojar说，他是该研究的主要作者，发表在《Cell Reports Methods》上。

人工智能增强方法发现模式

还有其他的研究小组也在研究聚糖的亚结构，以寻找所谓的生物标志物来描述问题所在。这通常涉及到使用质谱的统计测试，以找出个体糖的水平在癌症中是显着高还是显着低。这些测试灵敏度太低，不可靠，因为不同的糖在结构上是相关的，因此不是相互独立的。

Daniel Bojar的研究团队使用了一种包括人工智能在内的新方法，该方法将这些问题考虑在内，并能在数据集中找到其他方法无法找到的模式。

“我们可以依靠我们的结果;它们在统计上是显著的。如果我们知道我们在寻找什么，就更容易找到正确的结果。现在我们将利用这些生物标记物开发测试方法，”Daniel Bojar说。

新型质谱仪

去年秋天，他的研究小组从伦德伯格基金会获得了400万瑞典克朗，用于购买最先进的质谱仪。该仪器将作为人工智能平台，支持研究人员研究聚糖，例如肺癌样本中的聚糖。其目的是尽早发现癌症，以提高康复的机会。

“我们希望开发一种可靠、快速的分析方法，通过血液样本或唾液来检测癌症和癌症类型。我认为我们可能能够在4-5年内对人体样本进行临床试验，”Daniel Bojar说。

Decoding glycomics with a suite of methods for differential expression analysis